A transmissão dos votos em Itajaí, Litoral Norte de Santa Catarina, começou com atrasos. O fim da votação foi às 17h, mas as mídias das urnas, contendo os votos dos itajaienses, só começaram a chegar depois das 17h30.

Em Itajaí, o registro dos votos foi concluída por volta das 20h15. Ao todo, 135.411 votas foram registrados. Na cidade, Jair Bolsonaro (PL) recebeu 66,43% dos votos, e Lula, 25,64%. Foram 132.299 votos válidos, 1.972 em branco, 2.859 nulos, e 0 votos anulados.
Para Senador, Jorge Seif (PL) foi o mais votado, com 56.298 votos, ou seja, 49,34%. Ele foi eleito para o Senado Federal. Já para Governador, o mais votado foi Jorginho Mello (PL), com 58.135 votos, ou seja, 47,73%. Ele deve disputar o segundo turno com Décio Lima (PT).
Para Deputado Federal, Marcio Gonçalves (UB), o Dedé, foi o candidato mais votado na cidade, com 20.600 votos. Em segundo lugar, Marcelo Werner (PSC), com 17.339 votos. Deputado Estadual Osmar Teixeira (Solidariedade ) fez 20.213 votos. Ana Campagnolo (PL) recebeu 15.273 votos em Itajaí.
O primeiro colégio a concluir a votação foi o Centro de Educação Infantil Vereador Heluiz Antônio Moraes Gonzaga, que fica na mesma rua do Cartório Eleitoral. Em seguida, chegaram os resultados dos colégios Fayal, Francisco de Paula Seara e Nilton Kuker, que também ficam próximas ao cartório.

As mídias, onde são registrados os votos, são transportados por motoboys de uma empresa contratada. As ruas ao redor do Cartório Eleitoral foram fechadas já pela manhã. A Polícia Militar mantém a segurança no local.
Uma hora e meia depois do fim da votação, não haviam dados dos votos de Itajaí no sistema oficial do TSE (Tribunal Superior Eleitoral).
Os atrasos na votação, segundo a Justiça Eleitoral, se deram por conta de demoras na coleta da biometria dos eleitores, além do número maior de candidatos para votar. Com isso, filas se formaram nas zonas eleitorais, o que acabou atrasando também o fim da votação. Às 17h, escolas de Itajaí ainda registravam filas de eleitores, que receberam senhas para garantir o voto.